No. | Location | Nucleotide | Sequence Change | Amino Acid Change | Frequency of Variant Alleles | dbSNP | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
African-American | Caucasian-American | Han Chinese-American | Mexican-American | |||||||||
GSTO1 polymorphism | ||||||||||||
1 | 5′-FR | -1309 | T→C | 0.175 | 0.000 | 0.075 | 0.008 | |||||
2 | 5′-FR | -1276 | G→A | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
3 | 5′-FR | -1242 | G→A | 0.125 | 0.292 | 0.142 | 0.233 | rs 2164624 | ||||
4 | 5′-FR | -883 | C→T | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
5 | 5′-FR | -851 | G→T | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
6 | 5′-FR | -320 | A→G | 0.017 | 0.142 | 0.150 | 0.092 | rs 1191975 | ||||
7 | 5′-FR | -243 | T→C | 0.250 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
8 | 5′-FR | -220 | A→G | 0.008 | 0.042 | 0.025 | 0.000 | rs 628480 | ||||
9 | 5′-FR | -206 | A→T | 0.042 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
10 | IVS 1 | 5 | G→A | 0.035 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | rs 629771 | ||||
11 | IVS 1 | 49-51 | GGC deletion | 0.083 | 0.241 | 0.134 | 0.217 | rs 11509435 | ||||
12 | Exon 2 | 42 | G→T | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
13 | Exon 2 | 95 | G→A | Cys(32) Tyr | 0.000 | 0.009 | 0.000 | 0.000 | ||||
14 | IVS 3 | 13 | G→T | 0.297 | 0.000 | 0.008 | 0.01 | |||||
15 | IVS 3 | -112 | G→A | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
16 | IVS 3 | -102 | C→T | 0.300 | 0.000 | 0.008 | 0.008 | rs 7101149 | ||||
17 | Exon 4 | 419 | C→A | Ala (140) Asp | 0.117 | 0.263 | 0.142 | 0.233 | rs 4925* | |||
18 | Exon 4 | 464-466 | AGG deletion | Δ Codon 155 | 0.042 | 0.025 | 0.008 | 0.025 | rs 11509437 | |||
19 | IVS 4 | 28 | A→G | 0.008 | 0.033 | 0.025 | 0.000 | rs 17884170 | ||||
20 | IVS 4 | 34 | C→A | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
21 | IVS 4 | -60 | T→C | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
22 | IVS 5 | 42 | G→T | 0.283 | 0.000 | 0.008 | 0.008 | rs 7906892 | ||||
23 | IVS 5 | 70 | A→T | 0.283 | 0.000 | 0.008 | 0.008 | rs 7906559 | ||||
24 | IVS 5 | 88 | T→C | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
25 | IVS 5 | 98 | C→T | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
26 | IVS 5 | 186 | A→G | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
27 | IVS 5 | -100 | A→G | 0.300 | 0.000 | 0.008 | 0.008 | |||||
28 | IVS 5 | -55 | T→A | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
29 | Exon 6 | 622 | G→A | Glu (208) Lys | 0.042 | 0.025 | 0.008 | 0.025 | rs 11509438* | |||
30 | Exon 6 | 707 | C→T | Ala (236) Val | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.050 | rs 11509439 | |||
31 | 3′-UTR | 728 | G→A | 0.300 | 0.000 | 0.008 | 0.008 | rs 7589 | ||||
GSTO2 polymorphisms | ||||||||||||
32 | 5′-FR | -2012-2013 | Insertion of G | 0.292 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
33 | 5′-FR | -1785 | T→G | 0.050 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | rs 529232 | ||||
34 | 5′-FR | -1771 | G→C | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
35 | 5′-FR | -1664 | C→T | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
36 | 5′-FR | -1598 | C→G | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
37 | 5′-FR | -1576 | G→C | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
38 | 5′-FR | -1566 | G→A | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
39 | 5′-FR | -1541 | C→T | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
40 | 5′-FR | -1357 | C→A | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | rs 12264646 | ||||
41 | 5′-FR | -1189 | T→C | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | rs 10509769* | ||||
42 | 5′-FR | -1179 | G→T | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
43 | 5′-FR | -1105 | G→A | 0.117 | 0.258 | 0.167 | 0.242 | |||||
44 | 5′-FR | -1102 | T→G | 0.217 | 0.683 | 0.767 | 0.692 | rs 641071* | ||||
45 | 5′-FR | -1009 | C→T | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | rs 12264844* | ||||
46 | 5′-FR | -781 | A→C | 0.283 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
47 | 5′-FR | -730-731 | Insertion of T | 0.283 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
48 | 5′-FR | -637 | C→T | 0.275 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
49 | 5′-FR | -634 | C→G | 0.275 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
50 | Exon 1 | -625 | A→G | 0.000 | 0.000 | 0.017 | 0.000 | |||||
51 | Exon 1 | -530 | C→G | 0.271 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
52 | Exon 1 | -526 | C→A | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
53 | Exon 1 | -463 | G→A | 0.271 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
54 | Exon 1 | -450 | A→C | 0.271 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
55 | Exon 1 | -424 | G→A | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
56 | Exon 1 | -410 | T→G | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
57 | Exon 1 | -293 | A→T | 0.050 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
58 | Exon 1 | -234 | C→T | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
59 | IVS 1 | 52 | A→G | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
60 | IVS 1 | 152 | G→T | 0.033 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
61 | IVS 1 | 310-311 | Deletion of CG | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
62 | IVS 1 | 311 | G→A | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
63 | IVS 1 | 333 | T→C | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
64 | IVS 1 | 402 | C→T | 0.042 | 0.025 | 0.017 | 0.025 | |||||
65 | IVS 1 | 426 | T→C | 0.050 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
66 | IVS 1 | 435 | T→A | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
67 | IVS 1 | 477-478 | Insertion of T | 0.008 | 0.033 | 0.033 | 0.000 | |||||
68 | IVS 1 | 1694 | A→G | 0.050 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
69 | IVS 1 | 2003 | A→G | 0.300 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
70 | IVS 1 | 2146 | A→G | 0.000 | 0.017 | 0.000 | 0.008 | |||||
71 | IVS 1 | 2168 | G→A | 0.200 | 0.000 | 0.017 | 0.017 | |||||
72 | IVS 1 | -1131 | C→T | 0.417 | 0.025 | 0.017 | 0.025 | |||||
73 | IVS 1 | -185 | A→G | 0.060 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
74 | IVS 1 | -19 | T→A | 0.000 | 0.000 | 0.008 | 0.000 | |||||
75 | IVS 1 | -12 | G→A | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
76 | Exon 2 | -183 | A→G | 0.108 | 0.242 | 0.175 | 0.183 | |||||
77 | IVS 2 | -16 | C→T | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||||
78 | Exon 3 | 121 | G→A | Val (41) Ile | 0.009 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | ||||
79 | IVS 4 | 20 | C→T | 0.200 | 0.560 | 0.642 | 0.667 | rs 157077* | ||||
80 | IVS 4 | 39 | C→T | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
81 | IVS 4 | -38 | A→C | 0.000 | 0.017 | 0.000 | 0.017 | |||||
82 | Exon 5 | 389 | G→A | Cys (130) Tyr | 0.008 | 0.000 | 0.017 | 0.000 | ||||
83 | Exon 5 | 424 | G→A | Asn (142) Asp | 0.233 | 0.692 | 0.783 | 0.742 | rs 156697* | |||
84 | IVS 5 | 74 | G→A | 0.233 | 0.692 | 0.783 | 0.742 | |||||
85 | IVS 5 | 170 | T→C | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
86 | Exon 6 | 472 | C→A | Leu (158) Ile | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | ||||
87 | IVS 6 | -55 | C→G | 0.058 | 0.000 | 0.008 | 0.000 | |||||
88 | IVS 6 | -21 | C→T | 0.108 | 0.000 | 0.008 | 0.000 | |||||
89 | Exon 7 | 591 | G→T | 0.167 | 0.033 | 0.133 | 0.017 | rs 3758571 | ||||
90 | Exon 7 | 630 | C→T | 0.117 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | rs 157078 | ||||
91 | 3′-FR | 1038 | C→T | 0.175 | 0.033 | 0.133 | 0.017 | rs 12219470 | ||||
92 | 3′-FR | 1080 | C→T | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.008 | |||||
93 | 3′-FR | 1243 | A→G | 0.000 | 0.017 | 0.000 | 0.000 | |||||
94 | 3′-FR | 1343 | T→G | 0.125 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | rs 17116848 | ||||
95 | 3′-FR | 1615 | C→T | 0.000 | 0.008 | 0.000 | 0.000 | |||||
96 | 3′-FR | 1649 | T→C | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.008 | |||||
97 | 3′-FR | 1724 | C→T |
| 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
|
rs, ref SNP ID.